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为什么选16S序列作为细菌鉴定的依据?

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北纳 殷世腾 2020-12-22 12:53 评论( 0 ) 398
16S序列是原核生物的核糖体RNA,原核生物除了16SRNA之外,还包括5S和23SRNA。在真核生物中相应的为5S,5.8S,18S以及28S RNA。这其中的S指的是沉降系数,S前面的数值越大,表示核糖体的长度越长。 一般在原核生物中5S RNA长度约为120个碱基,16S长度约为1540个碱基而23S约为2900个碱基。综合来看5S序列长度太短,没有特别高的唯一性,而23S序列又太长,不容易进行测序。16S RNA由于大小适中,约1.5Kb左右,既能体现不同菌属之间的差异,又能利用测序技术较容易地得到其序列,故被细菌学家和分类学家接受 16S物种鉴定的其他优势: 【1】rRNA参与生物蛋白质的合成过程,其功能是任何生物都必不可少的,而且在生物进化的漫长过程中,其功能保持不变,所以序列相对保守; 【2】在16S rRNA分子中,既含有高度保守的序列区域,又有中度保守和高度变化的序列区域,因而它适合用于进化距离不同的各类生物亲缘关系的研究; 【3】16S rRNA分析相对分子大小适中,便于序列分析。1540左右的碱基,sanger测序测两端可以得到全长序列; 【4】16S或者18S普遍存在于生物中,并且核糖体rRNA在细胞中含量大,便于提取; 【5】现在已知的16S数据库中的数据比较丰富,便于序列比对;
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